《明清医学论温疫》从明清时期的五十余部温病著作中，选出《温疫论》、《温热暑疫全书》、《广瘟疫论》、《伤寒温疫条辨》、《疫疹一得》、《温病条辨》、《霍乱论》、《辨疫琐言》、《治疫全书》、《时病论》、《疫痧草》、《松峰说疫》等共16部温病著作展开深入研究。全书分为三部分，第一部分，温疫源流与发展。第二部分，明清医家防治温疫思想与方法。第三部分，明清医家防治温疫经验的思考与启示。《明清医学论温疫》对16位医家从学术思想到所用药物、方剂统计、预防方法等进行了全面整理与研究，为今人防治瘟疫提供了新的研究思路。

第一部分 温疫源流与发展
一、温疫的初起认识阶段
二、温疫的逐步发展阶段
三、温疫的深入研究阶段
四、温疫的成熟完善阶段

第二部分 明清医家防治温疫的思想与方法
第一章《增评伤暑全书》——明·张凤逵
一、作者生平
二、学术思想
三、温疫防治方药特色
第二章《温疫论》——明·吴又可
一、作者生平
一 学术照棚
三、温疫防治方药特色
第三章 《温热暑疫全书》——清·周扬俊
一、作者生平
二、学术思想
三、温疫防治方药特色
第四章 《广瘟疫论》——清·戴天章
一、作者生平
二、学术思想
三、温疫防治方药特色
第五章 《伤寒温疫条辨》——清·杨栗山．
一、作者生平
二、学术思想
三、温疫防治方药特色
四、《伤寒温疫条辨》验案举隅
第六章 《疫疹一得》——清·余师愚
一、作者生平
二、学术思想
三、温疫防治方药特色
第七章 《温病条辨》——清·吴鞠通
一、作者生平
二、学术思想
三、温疫防治方药特色
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第三部分 明清医家防治温疫经验的思考与启示