1．2．2调查方法和内容
根据30个保护区国家重点保护动植物的长期调查结果，进行实地重点踏查，按照计数法、线样调查法、样地调查法等对保护区的珍稀濒危保护植物及其丰富度进行调查。主要调查指标有：动植物种类和数量、消长情况、物种资源变化动态、发现新种和新记录种概况等，对保护区内珍稀濒危且存在很少的动植物物种，采取走访那些曾在保护区研究、工作过的老专家、教授，咨询在保护区长期从事生物多样性研究工作的技术人员和保护区内的居民，并结合相关资料进行野外踏查，对重点保护野生动物资源进行调查。
对30个不同类型自然保护区进行的实地调查内容主要包括：各自然保护区内动植物区系的调查，包括重点保护的动植物、区系组成分析、珍稀濒危动植物种类、数量等；自然保护区内重点保护物种的资源消长变化、保护现状等；重点保护物种受威胁的主要因素、已采取的保护措施等。在总结自然保护区过去多年物种资源调查成果的基础上，对影响植物群落与动物群落动态变化的原因进行综合分析，探究其物种保护和管理现状及其存在的深层次原因，从而提出各自然保护区内生物物种资源保护的建议，包括政策法规、制度管理、科技开发、宣传教育、资金保证、人力资源、能力建设、效益体现等多方面的保护措施和相关对策建议。
1．3典型自然保护区国家重点保护物种资源状况
调查结果表明，20多年来部分野生动植物种群数量稳中有升，栖息环境逐渐改善，其中60％为国家重点保护的物种，大熊猫、朱鹃、海南坡鹿等珍稀濒危野生动物种群在不断增加，其栖息地面积也在不断增加；被调查的156种国家重点保护野生植物中，野外种群达到稳定存活标准的占68％。一些物种的分布区逐步扩展，黑嘴鸥、黑脸琵鹭等物种的新记录、新繁殖地或越冬地不断被发现；几十年未见踪迹的世界极危物种崖柏在重庆大巴山区被重新发现，笔筒树、白豆杉、观光木等物种也发现了新分布区。
但是，由于近年来人为活动范围的扩大以及保护区建设与管理的不当，野生生物栖息地遭到破坏和过度开发利用，一些非国家重点保护的野生动植物，特别是具有较高经济价值的野生动植物种群仍未扭转下降趋势，部分物种仍处于极度濒危状态，单一种群物种面临绝迹的危险。
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