在系统开发的同时，全国组织机构代码管理中心结合部分省市的数字档案工作开展情况，在《组织机构代码档案管理办法》的基础上制订了《组织机构代码数字档案管理及技术规范》（征求意见稿），于2004年10月召开了“数字档案管理及技术规范研讨会”，广泛征求了46个省市代码管理机构的意见，对该技术规范进行了充分的论证。2004年11月，全国组织机构代码管理中心正式发布了《组织机构代码数字档案管理及技术规范》（1.0版）。这个规范对组织机构代码档案数字化工作进行了更为明确的规定，涉及了数字档案元数据标准、图像保存格式、图像大小、图像质量要求、压缩方法、标引规范等多方面的规定。
2004年年底，全国组织机构代码管理系统开展了“组织机构代码创新工程（一期）”的科研课题研究工作。“组织机构代码创新工程”不是一个单独的科研项目，而是定期确定一系列代码工作的科研项目，由各级代码管理机构来承担研发工作。通过这项工作的开展，全国组织机构代码管理中心确定了一批具有研究价值的代码档案数字化方面的课题，交由各级代码管理机构承担。因此，全国很多省市的代码档案数字化的工作通过科研等形式先期开展了起来。
2005年年初，全国组织机构代码管理中心申报的《组织机构代码数字档案系统研究与实施》课题也在国家质检总局科技计划项目立项，以科研的形式先期开展。
2005年年初，为做好在全国范围内大规模开展代码数字档案工作的准备，全国组织机构代码管理中心开展了数字档案硬件工作设备的选型工作。在设备选型工作中，代码中心走访了数家公司，实地考察了这些公司的基地生产线，对各种品牌的设备进行了反复的测试，最终选定了适合代码数字档案工作的计算机和扫描仪。同时，面对基层代码颁证点工作设备老化的现实，代码中心还对全国各省、地、县级代码管理机构的设备使用情况进行了统计，并基于全国代码系统现有的财力，重点更换了中、西部地区及其他省市的国家级贫困县颁证点的工作设备，配备了一批满足数字档案工作要求的计算机、扫描仪等工作设备，为数字档案工作的开展奠定了坚实的物质基础。
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