在医学界广为传颂的“协和三宝”即图书馆、病历和严格的住院医师培养制度被誉为是协和培养优秀医学人才的法宝。尤其是住院医师制度真正体现了“三基三严”，即基础理论、基本知识、基本技能和严肃态度、严格要求、严密方法。协和医院的查房制度曾被认为是培养年轻医生的“法宝”。
责任医师查房：直接负责病人的实习医师、住院医师定时查看自己所管的病人。
病房主治医师查房：每天例行查房、检查病情，检查住院医师、实习医师的工作，提出修改意见，结合实际病例进行床边教学，是言传身教，影响下级的重要环节。
总住院医师查房：在全科范围内重点查房，通过查房指导住院医师、实习医师处理危重和疑难病人，结合病例床边教学。也可以是科内跨病区查房，不同病区的住院医师相互学习。
科主任查房、科内大查房：结合病房实际，进行专业内的诊疗方案的讨论教学。在科主任查房时，住院医师哪怕是头一天刚接班，也必须熟悉病情，流畅地把病历背出来。
全内科或全外科等全院性大查房：对特殊病例、跨学科病例进行讨论，以进行教学……
协和医院的大查房80多年来坚守一贯的程序，具体为五大步骤：
第一步是选择病历：总住院医师从内科各专科选出有特点的病例，经主治医师同意，大内科主任认可，先行公布。所选择的病例是较复杂和疑难的，或者是罕见的病例，或在诊断和治疗中有不易解决的问题，或有某种新的经验教训值得学习和重视。简单地说，多属疑难重症、诊断不明、治疗无效，需经多科会诊、跨学科思维才能解决。
第二步是准备病例汇报。负责这个病人的住院医师，精心准备病历摘要、各种化验检查、影像学检查、病理检查结果。要“特别熟悉病人的病历、诊断和治疗过程的详细情况，并准备提出当时尚待解决的问题。”主治医师则准备在大查房会上做中心发言。他需要悉心思考、阅读文献，为病例诊断与治疗提出充足的依据，征求本专科专家的意见。
第三步是病例汇报。住院医师完整、扼要地汇报完病人病史后，病人被带到大查房现场，在大内科主任现场指导下，各级医师对病人进行体检和病史询问，然后主治医师进行中心发言。
第四步是自由讨论。这是大查房最精彩的部分。各科室之间，相互提问和解释。申请大查房的专科医生，先发表自己的看法，包括鉴别诊断、治疗意见，以及国际上治疗这类疾病的进展。其他科室医生，对与该病相关的问题作出解答。放射、超声、病理、检验等科室医师，对检查结果发表自己的见解。
第五步是大内科或专科主任总结性发言，表明自己的见解，并指示下一步的诊治措施。一时未能解答的问题，可进一步观察检查，或从外科手术的手术发现给予回答。如病人不幸死亡，则可能从尸检结果得到答案。如有新的资料，在以后的大查房时做追随报告。
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