在国家积极推进下，建立了以高等院校、科研院所、企业为中心的学科研究与产业发展平台，通过重点实验室、工程中心等研发推广平台建设，将政产学研资源进行整合，成为为政府和企业提供决策支持、技术创新、人才培养和产业化应用服务的全方位科技平台。
1.重点实验室
“十一五”期间，新建环境保护类国家级重点实验室2家，即城市水资源与水环境国家重点实验室和环境化学与生态毒理学国家重点实验室。到目前为止，共有环境类国家级重点实验室11家，主要涉及环境资源、水、环境化学三个方面。
这期间，环保部也加强了对重点实验室的建设力度，通过验收并命名的重点实验室6家，批准建设的实验室6家。截至2010年年底，共建成11个国家环境保护重点实验室，另有9个国家环境保护重点实验室正在建设中。初步建成了与环境科技、环境管理和综合决策相适应的重点实验室体系，形成了重点突出、布局合理、规模适度、技术先进和运行高效的科研实验平台，使其成为我国环境应用基础研究的核心力量和原始性知识创新的重要基地。进一步推进前沿与高新技术的发展，加强重大环境技术的国际交流和合作将是今后的发展方向。
2.工程中心
工程技术中心是国家组织重大环境科技成果工程化、产业化、聚集和培养科技创新人才、组织科技交流与合作的重要基地。目前，我国建成和在建的环境类国家级工程研究中心（发改委）有9家，环境类国家级工程技术研究中心（科技部）有11家，技术领域涵养了水处理、固废处理、清洁能源、行业减排等技术领域，为我国环境产业升级改造提升了产业化平台。
环境保护部到目前为止建成和批建了27个部级工程技术中心，已建和在建工程中心的依托单位中，有企业14家，科研院所8家，高校5家。工程中心领域涵盖了水、气、固废、噪声、监测、农村和生态、重点污染工业行业、技术管理与评估等主要污染防治领域和技术支持领域。“十一五”期间，通过验收并命名的工程技术中心5家，批准建设的工程技术中心8家。这些中心为我国环境政策咨询、环境标准规范研究、环保产业化示范推广等环境管理工作提供了良好的平台支撑。
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